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PCR技術總結

PCR技術總結 | 時間: December-16 12:59:50 | 分類:技術欄目

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PCR技術簡史
  PCR的較早設想 核酸研究已有100多年的歷史,本世紀60年代末、70年代初人們致力于研究基因的體外分離技術,Korana1971年較早提出核酸體外擴增的設想:經過DNA變性,與合適的引物雜交,用DNA聚合酶延伸引物,并不斷重復該過程便可克隆tRNA基因
  PCR的實現 1985年美國PE-Cetus公司人類遺傳研究室的Mullis 等發明了具有劃時代意義的聚合酶鏈反應。其原理類似于DNA的體內復制,只是在試管中給DNA的體外合成提供以致一種合適的條件---摸板DNA ,寡核苷酸引物,DNA聚合酶,合適的緩沖體系,DNA變性、復性及延伸的溫度與時間。
  PCR的改進與完善 Mullis較初使用的DNA聚合酶是大腸桿菌 DNA 聚合酶 I Klenow片段,其缺點是:Klenow酶不耐高溫, 90會變性失活,每次循環都要重新加。引物鏈延伸反應在37下進行,容易發生模板和引物之間的堿基錯配,其PCR產物特異性較差,合成的DNA片段不均一。此種以Klenow酶催化的PCR技術雖較傳統的基因擴增具備許多突出的優點,但由于Klenow酶不耐熱,在DNA模板進行熱變性時,會導致此酶鈍化,每加入一次酶只能完成一個擴增反應周期,給PCR技術操作程序添了不少困難。這使得PCR技術在一段時間內沒能引起生物醫學界的足夠重視。
  1988年初,Keohanog改用T4 DNA聚合酶進行PCR,其擴增的DNA片段很均一,真實性也較高,只有所期望的一種DNA片段。但每循環一次,仍需加入新酶。
  1988Saiki 等從溫泉中分離的一株水生嗜熱桿菌(thermus aquaticus) 中提取到一
種耐熱DNA聚合酶。 此酶具有以下特點:耐高溫,在70下反應2h后其殘留活性大于原來的90%,在93下反應2h后其殘留活性是原來的60%,在95下反應2h后其殘留活性是原來的40%在熱變性時不會被鈍化,不必在每次擴增反應后再加新酶。大大提高了擴增片段特異性和擴增效率,增加了擴增長度(2.0Kb)。由于提高了擴增的特異性和效率,因而其靈敏性也大大提高。為與大腸桿菌多聚酶I Klenow片段區別,將此酶命名為Taq DNA多聚酶(Taq DNA Polymerase)。此酶的發現使PCR廣泛的被應用。
PCR
技術的基本原理
  PCR技術的基本原理 類似于DNA的天然復制過程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。PCR由變性--退火--延伸三個基本反應步驟構成:
  模板DNA的變性:模板DNA經加熱至93左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結合,為下輪反應作準備;
  模板DNA與引物的退火(復性):模板DNA經加熱變性成單鏈后,溫度降至55左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結合;
  引物的延伸:DNA模板--引物結合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP為反應原料,靶序列為模板,按堿基配對與半保留復制原理,合成一條新的與模板DNA 鏈互補的半保留復制鏈重復循環變性--退火--延伸三過程,就可獲得更多的半保留復制鏈,而且這種新鏈又可成為下次循環的模板。每完成一個循環需24分鐘, 23小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍。(Plateau) 到達平臺期所需循環次數取決于樣品中模板的拷貝。
  PCR的反應動力學  PCR的三個反應步驟反復進行,使DNA擴增量呈指數上升。反應較終的DNA 擴增量可用Y(1X)n計算。Y代表DNA片段擴增后的拷貝數,X表示平(Y)均每次的擴增效率,n代表循環次數。平均擴增效率的理論值為100%,但在實際反應中平均效率達不到理論值。 反應初期,靶序列DNA片段的增加呈指數形式,隨著PCR產物的逐漸積累,被擴增的DNA 片段不再呈指數增加,而進入線性增長期或靜止期, 即出現停滯效應這種效應稱平臺期數、PCR 擴增效率及DNA聚合酶PCR的種類和活性及非特異性產物的竟爭等因素。大多數情況下,平臺期的到來是不可避免的。
  PCR擴增產物  可分為長產物片段和短產物片段兩部分。短產物片段的長度嚴格地限定在兩個引物鏈5'端之間,是需要擴增的特定片段。短產物片段和長產物片段是由于引物所結合的模板不一樣而形成的,以一個原始模板為例,在第一個反應周期中, 以兩條互補的DNA為模板,引物是從3'端開始延伸, 5'端是固定的,3' 端則沒有固定的止點,長短不一,這就是長產物片段。進入第二周期后,引物除與原始模板結合外,還要同新合成的鏈(長產物片段”)結合。引物在與新鏈結時, 由于新鏈模板的5'端序列是固定的, 這就等于這次延伸的片段3'端被固定了止點, 保證了新片段的起點和止點都限定于引物擴增序列以內、形成長短一致的短產物片段。不難看出短產物片段是按指數倍數增加, 長產物片段則以算術倍數增加, 幾乎可以忽略不計, 這使得PCR的反應產物不需要再純化,就能保證足夠純DNA片段供分析與檢測用。

 

 

 

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